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京都大学は４月１日付けで事務組織を再編した。教育研究推進本部、経営企画本部、センターは事務本部として一つにまとめられ、それに伴い従来の部局・センターは統合・廃止された。今回の再編により、事務組織の単位は従来の１０部２２課２室１１センターから７部２７課２室１センターとなる。第二期中期目標期間の事務改革アクションプランによる見直しのためだという。０６年にも法人化後に大学が推進する事務改革の一環で大規模な再編が行われたが、その際は給与や資産に関わる専門的業務や日常業務を全学で一元化することを目的として新たに「センター」を新設した。だが、担当が複雑だったので、指揮・命令の手続きを効率化するためにセンターの廃止を行ったと４月２１日の情報公開連絡会で赤松理事は説明した。事前に学生への説明はされなかったが、事後的に情報公開連絡会で、４月５日の学生生活委員会の報告として学務部の組織構成について説明という形になった。

学生部と学生センターと教育推進部は統合され、学務部となった。学生センター課外担当グループは学務部学生課課外活動掛、同経済担当グループは学務部奨学厚生課奨学掛、同生活担当グループは学務部奨学厚生課厚生掛となったが、窓口の場所はそのままで、学生の利用に関しては以前と変わらない。

再編前

●本部
・監査室

●教育研究推進本部
・学生部―学生課　入試企画課
・研究推進部―研究推進課　産官学連携課
・国際部―国際交流課　留学生課
・教育推進部―教務企画課　共通教育推進課

●経営企画本部
・総務部―総務課　広報課　職員課　人事課　事務改革推進室
・企画部―企画課　社会連携推進課
・財務部―財務課　監理課
・施設環境部―施設企画課　施設整備課　施設活用課
・環境安全衛生部―環境安全衛生課
・情報環境部―情報企画課　情報基盤課　統合認証センター

●センター
・学生センター
・キャリアサポートセンター
・競争的資金サポートセンター
・国際交流サービスオフィス
・人事・共済事務センター
・出納事務センター
・契約・資産事務センター
・共用施設アセットマネジメントセンター
・施設サポートセンター
・情報システム管理センター

再編後

●事務本部
・監査室
・総務部―総務課　企画課　広報課　事務改革推進室　リスク監理課　人事課　職員課
・渉外部―渉外企画課　社会連携推進課
・財務部―財務課　監理課　経理課　資産課
・施設部―企画課　環境安全保健課　整備課　管理課
・情報部―情報推進課　情報基盤課
・学務部―学生課　奨学厚生課　キャリアサポートセンター　教務企画課　共通教育推進課　入試企画課
・研究国際部―研究推進課　産官学連携課　国際交流課　留学生課